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Sekirov定義微生物區(qū)是，認(rèn)為其是作為一個(gè)對(duì)宿主沒(méi)有傷害、在體內(nèi)共生繁殖的微生物。Freter定義腸道微生物區(qū)：“沒(méi)有受到醫(yī)學(xué)或?qū)嶒?yàn)性干預(yù)或疾病影響的個(gè)體人或動(dòng)物宿主中，定居在胃腸道區(qū)域的細(xì)菌群體，通常復(fù)雜的混合物”。

平衡的腸道微生物群落提供了抵抗病原體定居的屏障并且有助于宿主的整體健康。此外，它們產(chǎn)生代謝底物如維生素和短鏈脂肪酸，并刺激免疫系統(tǒng)。

雞腸道微生物群產(chǎn)生能夠解聚膳食多糖的酶。這些酶對(duì)宿主營(yíng)養(yǎng)至關(guān)重要，因?yàn)殡u缺乏促進(jìn)該過(guò)程所必需的酶的基因。在膳食多糖的解聚過(guò)程中，腸細(xì)菌產(chǎn)生短鏈脂肪酸（SCFA）。所產(chǎn)生的常見(jiàn)是乙酸鹽，然后是丙酸鹽和丁酸鹽。丁酸或丁酸是結(jié)腸上皮的主要能量來(lái)源，并且已被證明對(duì)于結(jié)腸細(xì)胞的內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定和腸絨毛的形態(tài)發(fā)育至關(guān)重要。已經(jīng)證明丁酸可以改善雞的生長(zhǎng)性能和胴體質(zhì)量特性。

腸道微生物群也有助于氮代謝。建明工業(yè)出品。在腸道中早期逃脫宿主代謝的膳食蛋白質(zhì)的微生物代謝為蛋的生產(chǎn)，維持和生長(zhǎng)提供了進(jìn)一步的氨基酸。家禽的腸道微生物群也可以作為其宿主的維生素（特別是B族維生素）供應(yīng)商。與細(xì)菌蛋白質(zhì)類似，由腸細(xì)菌合成的大多數(shù)維生素在糞便中排泄，因?yàn)樗鼈儾荒鼙幻つc吸收。

新孵出的小雞的胃腸道沒(méi)有微生物，但是后來(lái)被存在于周圍環(huán)境中的微生物定殖，即在運(yùn)輸?shù)睫r(nóng)場(chǎng)和農(nóng)場(chǎng)期間。這種機(jī)會(huì)被環(huán)境中的腸道病原體利用作為附著和破壞腸粘膜層并且由于不存在正常腸道微生物群而導(dǎo)致新幼崽感染的機(jī)會(huì)。這是為什么新孵化的小雞非常容易受腸道感染如壞死性腸炎的原因之一。

雞腸維持其微生物群的良好平衡。對(duì)重要物種的任何干擾可導(dǎo)致致病微生物如沙門氏菌，彎曲桿菌，大腸桿菌和產(chǎn)氣莢膜梭菌的顯著增殖。

在感染之前的微生物群的預(yù)建立和維持對(duì)于維持雞腸健康是重要的。此外，通過(guò)沿著胃腸道占據(jù)，這種共生密集和復(fù)雜的微生物群落可以有效地阻斷大多數(shù)侵入性腸道病原體的附著和隨后的定殖。這種現(xiàn)象被稱為“競(jìng)爭(zhēng)排斥”。一些共生益生菌如枯草芽孢桿菌PB6（克洛生）也通過(guò)產(chǎn)生稱為表面活性素的次級(jí)抗菌物質(zhì)作為抗微生物化合物來(lái)控制病原體生長(zhǎng)。

腸道微生物在腸道發(fā)育中起重要作用。對(duì)種雞的研究表明，與肉雞相比，種雞的小腸和盲腸具有減輕的重量和更薄的壁。已經(jīng)提出由腸道微生物群產(chǎn)生的SCFA增加腸細(xì)胞生長(zhǎng)和增殖。腸道微生物群也影響家禽的腸道形態(tài)。腸絨毛更短，并且與常規(guī)飼養(yǎng)的雞相比，嗜菌性禽類或以低負(fù)荷的細(xì)菌定植的禽類的隱窩更淺。

益生菌物種（嗜酸乳桿菌，枯草芽孢桿菌和釀酒酵母）（建明工業(yè)出品）和益生元（例如低聚果糖和甘露寡糖）增加雞的腸中十二指腸絨毛高度和絨毛高度與隱窩深度比。病原體也可以改變腸形態(tài)。

腸道中的免疫功能是重要的，因?yàn)槠湓隗w內(nèi)具有最大的表面積，并且持續(xù)暴露于病原生物體和有害物質(zhì)。腸道已經(jīng)演變成進(jìn)行兩個(gè)明顯混雜的任務(wù)：營(yíng)養(yǎng)吸收和病原體防御。腸免疫系統(tǒng)由牢固的粘膜層，緊密互連的腸上皮細(xì)胞，分泌的可溶性免疫球蛋白A和抗微生物肽組成。粘膜層由微生物可以在其中定殖的外部松散層和排斥大多數(shù)細(xì)菌的內(nèi)部致密層組成。建明工業(yè)出品。作為腸粘膜先天免疫系統(tǒng)的組分，粘液層防止腸微生物滲透到腸上皮中并且作為抵抗感染的第一道防線。有益的微生物群落在維持正常的生理穩(wěn)態(tài)，調(diào)節(jié)宿主免疫系統(tǒng)和影響器官發(fā)育和宿主代謝中起關(guān)鍵作用。

腸道健康對(duì)于最大化家禽和豬的健康，福利和性能是重要的。操縱腸道微生物群是防止腸道感染和促進(jìn)宿主健康和雞生產(chǎn)性能的策略。膳食干預(yù)有助于調(diào)節(jié)這種腸道微生物組，以提高飼料轉(zhuǎn)化率和腸道健康。

添加益生菌（克洛生），益生元，短鏈脂肪酸，有機(jī)酸（乳酸寶）和精油（至多興）將有助于調(diào)節(jié)腸道微生物群，健康和改善動(dòng)物性能。這些產(chǎn)品作為抗生素生長(zhǎng)促進(jìn)劑（AGP）的替代物是有用的，其單獨(dú)或組合在肉雞和豬中。

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