在水產養殖中，飼料費用占養殖成本的６０％以上，降低飼料成本是增加養魚效益的關鍵。應用光合細菌，把農作物秸桿（如麥稈、稻草、玉米稈、花生殼等）生產成為魚生物飼料，不但養殖效益顯著提高，而且飼料成本還大幅降低。
光合細菌能產生多種促長因子、促免疫因子、輔酶Ｑ等，促進幼體生長發育，在水產養殖上有如下作用：
１、減少水體中有毒、有害物質的含量，消除死魚現象；
２、增加水體含氧量，減少或消除魚的浮頭現象；
３、減少開增氧機時間，減少換水，節電省工，生產成本顯著降低；
４、特別顯著地提高幼魚苗和成蝦的成活率；
５、消除魚蝦因細菌引起的皮膚病，使魚蝦外觀健壯；
６、顯著增加魚的食量，迅速增重，進而提高產量。
利用農作物秸稈生產魚生物飼料，其營養成分比玉米還要高，綜合營養好，并且由于體積大，比重小，在水中的懸浮時間長達１小時左右，是魚蝦較理想的飼料。
應用光合細菌，利用農作物秸稈生產高效魚生物飼料的具體方法如下：
１、將作物秸稈粉碎；
２、把秸稈粉放進發酵池內，加入秸稈粉重量８０％的水、１％的糖化酶、１％的復合酶、０.５％的活酵母和１％的氯化鈉以及０.５％的乳酸，充分攪拌均勻；
３、接入３％的光合細菌，在１５℃—３５℃溫度下培養２天時間，料層長滿白色菌絲發出香味即得高效魚生物飼料，可制成顆粒烘干貯存。
高效魚生物飼料含有較豐富的氨基酸和微量元素，富含豐富的Ｂ族維生素、葉酸、輔酶Ｑ等抗病毒物質和生物活性物質以及各種免疫促長因子。魚蝦食后能增強抗病能力，促進生長。其營養成分經檢測表明：含粗蛋白１２.３１％，粗脂肪４.２０％，粗纖維１９.２４％，其中三種主要氨基酸的含量為：賴氨酸０.６８％，蛋氨酸０.１６％，胱氨酸０.１９％。
使用高效魚生物飼料喂養魚蝦具有成活率高、病害少、換水少、產量高、成本低等優點。具體效果如下：
１、魚蝦的受精卵孵化率可提高２０％左右；
２、防治魚蝦病，可提高成活率２０％—４０％；
３、魚蝦的外觀健壯，肉質特好，并可提高產量２０％—３０％；
４、可減少開增氧機時間三分之二，降低生產費用；
５、把農作物秸稈變棄為寶，飼料成本降低６０％左右。
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