疫苗的免疫接種是飼養管理中關鍵的一環，在集約化養殖中顯得尤為重要，但究其本質而言，也是一種人為的應激反應。在產生免疫應答的同時，對機體也產生損傷。

　　凍干活苗的免疫反應
　　活疫苗免疫后常見的反應有：甩頭，流淚，打噴嚏，呼嚕，咳嗽等，這種反應一般在免疫后第2天～4天出現，再過5天～6天反應較重，以后逐漸減輕；有時出現精神不振、采食減少、拉綠色糞便等現象。常引起免疫反應的疫苗有ILT、IBD、ND等。
　　有些活疫苗可以根據是否出現反應來確定免疫效果。如雞痘疫苗接種后4天，接種部位可出現輕微腫脹，并出現黃色或紅色的結痂，反應持續3天～4天后減輕，14天～21天結痂消失。如沒出現這種反應，應在5天～7天后補種。球蟲疫苗免疫后，個別雞群拉紅色糞便，可自行恢復。傳喉凍干苗涂肛后，肛門黏膜發紅，有炎癥，標志免疫效果良好。一般來說，疫苗接種途徑的侵蝕性愈強，則疫苗反應就愈強烈，但產生的免疫力也愈強。例如，點眼法的侵害性強于粗粒噴霧，但產生的免疫力也強于粗粒噴霧，而粗粒噴霧的效果又優于飲水免疫。
　　由于其他因素的影響，如疫苗的種類、毒力、接種量、免疫途徑、雞群的健康狀況、敏感性以及是否發生細菌性感染等，免疫接種后常出現嚴重的反應，如生長率和飼料報酬降低，抵抗力下降，在病原微生物的侵害下極易引起發病，死淘率和藥物費用增加。

　　加重凍干苗免疫反應的因素

　　雞群的健康
　　雞群在健康的情況下才能免疫，才能產生良好的免疫應答。飼料質量低劣，維生素缺乏；管理粗放，如：通風不良，墊料發霉、粉塵多、密度大，應激頻繁；免疫前有呼吸道癥狀、大腸桿菌等疾病以及存在免疫抑制性疾病，都可降低雞群的抵抗力，特別是有些誘因可造成呼吸道黏膜損傷，免疫后不但不能產生良好的免疫應答，還會出現嚴重的應激反應，如呼吸道癥狀加重，反應時間增長，死淘率增加等。所以加強飼養管理，作好其他疾病的防治工作，確保雞群在免疫前健康，可減輕疫苗反應。
　　母源抗體水平
　　母源抗體水平較低、不整齊，免疫反應較嚴重，可發生綿延起伏的反應。母源抗體水平高、整齊一致時，對免疫反應有抵抗力，免疫應激較小。但母源抗體過高，疫苗能中和母源抗體，不能產生足夠的保護率。所以免疫前進行抗體檢測，以確定最佳免疫日齡。
　　免疫途徑
　　相同的疫苗，免疫途徑不同，應激反應的大小也不同。如新城疫IV系氣霧免疫時，應激強烈，容易誘發支原體等疾病，采用點眼、滴鼻應激相對較小，飲水免疫時，應激反應很輕。傳染性喉氣管炎點眼時，常出現流淚、腫眼、咳嗽等反應，而采取涂肛的方式，很少出現這種現象。疫苗的毒力相同，采取不同免疫途徑，應激反應的大小也不一樣。如新城疫I系注射免疫效果較好，應激反應較小，而采取飲水免疫時，應激反應強烈：雞群出現呼吸道癥狀，嚴重的發生非典型新城疫。所以應根據不同的疫苗及毒力的強弱，盡可能選擇免疫效果好、應激反應小的免疫途徑。